Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms