Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc2Q6PDG5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc2Q6PDG5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms