Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trak2Q6P9N8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms