Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc148Q6P5U8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms