Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl3Q6P1Y1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl3Q6P1Y1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl3Q6P1Y1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl3Q6P1Y1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl3Q6P1Y1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl3Q6P1Y1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl3Q6P1Y1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl3Q6P1Y1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl3Q6P1Y1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl3Q6P1Y1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl3Q6P1Y1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms