Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms