Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc66Q6NS45 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms