Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mvb12bQ6KAU4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms