Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms