Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Smarca2Q6DIC0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca2Q6DIC0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms