Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms