Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms