Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fgd6Q69ZL1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd6Q69ZL1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms