Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pkp4Q68FH0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pkp4Q68FH0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pkp4Q68FH0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pkp4Q68FH0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pkp4Q68FH0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pkp4Q68FH0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pkp4Q68FH0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pkp4Q68FH0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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