Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fnip1Q68FD7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms