Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms