Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms