Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q66JV7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q66JV7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q66JV7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q66JV7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q66JV7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q66JV7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q66JV7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms