Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sp9Q64HY3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sp9Q64HY3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sp9Q64HY3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp9Q64HY3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sp9Q64HY3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sp9Q64HY3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sp9Q64HY3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sp9Q64HY3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sp9Q64HY3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp9Q64HY3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms