Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf2Q64705 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms