Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms