Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CochQ62507 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CochQ62507 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CochQ62507 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CochQ62507 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CochQ62507 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CochQ62507 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CochQ62507 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CochQ62507 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CochQ62507 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CochQ62507 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CochQ62507 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms