Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms