Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SypQ62277 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SypQ62277 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SypQ62277 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SypQ62277 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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