Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttf1Q62187 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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