Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sema4aQ62178 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema4aQ62178 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema4aQ62178 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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