Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Prkd1Q62101 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Prkd1Q62101 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Prkd1Q62101 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Prkd1Q62101 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Prkd1Q62101 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prkd1Q62101 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Prkd1Q62101 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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