Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2f1Q61501 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2f1Q61501 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2f1Q61501 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2f1Q61501 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2f1Q61501 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2f1Q61501 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2f1Q61501 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2f1Q61501 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms