Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tfap2bQ61313 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms