Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stxbp3Q60770 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms