Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms