Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3aQ60520 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms