Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Arcn1Q5XJY5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arcn1Q5XJY5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms