Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms