Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms