Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc88aQ5SNZ0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms