Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms