Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Spata48Q5NC83 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spata48Q5NC83 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms