Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf2Q5NC05 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms