Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynaQ5G5D5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms