Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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