Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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