Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3lQ4KL14 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms