Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp235Q499D5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms