Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnah12Q3V0Q1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnah12Q3V0Q1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms