Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Usp48Q3V0C5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Usp48Q3V0C5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp48Q3V0C5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Usp48Q3V0C5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp48Q3V0C5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp48Q3V0C5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp48Q3V0C5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Usp48Q3V0C5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp48Q3V0C5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp48Q3V0C5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp48Q3V0C5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp48Q3V0C5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp48Q3V0C5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp48Q3V0C5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp48Q3V0C5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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Usp48Q3V0C5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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