Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed1Q3V009 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms