Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms