Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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