Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim40Q3UWA4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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